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在 GM 环境中会有 window 和 unsafeWindow（外部）区分。你说的网站的 jQuery 是 unsafeWindow 的 jQuery？
一般来说， 如果要使用 GM_getValue 等 API 最好 @require 方式使用自己 jQuery，外部的变量需要用 unsafeWindow.jQuery 方式（但是 GM2.0+ 会存在问题）。
不使用 GM API 可采用 @grant none 方式，这样就可以直接使用外部的变量。
你这个可能是 Tampermonkey 的一个潜在问题，它的运行时间如果早于 jQuery 的加载时间就会这样。可尝试插入 script 标签的方式。
谢谢！
叶大，请教一个问题，我的脚本在FX运行正常，但在Chrome就不行，脚本中用了网站的JQuery，谢谢了
Tampermonkey 提示：
Execution of script 'XXXX' failed! $ is not defined